MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 2347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	TAC	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018688	TCC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018688	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018688	AG	3	6	179	184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018688	T	6	6	299	304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018688	ATT	2	6	1454	1459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018688	ATA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018688	CAA	2	6	1586	1591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018688	TAC	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018688	ACAT	2	8	1608	1615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018688	ACTTTT	2	12	1657	1668	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018688	CTTT	2	8	1674	1681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018688	A	7	7	1691	1697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018688	A	6	6	1726	1731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018688	TAA	2	6	4555	4560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018688	CCT	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018688	T	6	6	4570	4575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018688	CCA	2	6	6653	6658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018688	T	6	6	6669	6674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018688	T	6	6	6698	6703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018688	A	6	6	7536	7541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018688	T	6	6	7587	7592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018688	GATT	2	8	7597	7604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018688	CTT	2	6	7613	7618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018688	ATA	2	6	12716	12721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018688	T	6	6	12782	12787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018688	TCA	2	6	12847	12852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018688	CAC	2	6	12913	12918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018688	TGG	2	6	12998	13003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018688	ATT	2	6	13017	13022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018688	TCTA	2	8	13023	13030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018688	AAC	2	6	13104	13109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018688	CAC	2	6	13132	13137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018688	CA	4	8	13146	13153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018688	TTG	2	6	13221	13226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018688	GTA	2	6	13300	13305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018688	CA	3	6	13349	13354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018688	TCT	2	6	13367	13372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018688	TGC	2	6	13376	13381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018688	ATA	2	6	13440	13445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018688	CTG	2	6	13449	13454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018688	ATT	2	6	13455	13460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018688	TTG	2	6	14013	14018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018688	TCCC	2	8	14843	14850	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_018688	ATC	2	6	15029	15034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018688	TAA	2	6	15043	15048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018688	TAA	2	6	15055	15060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018688	TAAA	2	8	15073	15080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018688	TTA	2	6	15086	15091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018688	CCT	2	6	15147	15152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018688	A	6	6	15163	15168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018688	TCC	2	6	17532	17537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018688	AACA	2	8	20937	20944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018688	T	6	6	21013	21018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018688	TC	3	6	22664	22669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018688	A	6	6	23796	23801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018688	CAA	2	6	23804	23809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018688	A	7	7	23808	23814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018688	ATTA	2	8	23855	23862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018688	CCAT	2	8	23865	23872	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018688	CTAACA	2	12	23881	23892	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018688	CAC	2	6	24191	24196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018688	TAT	2	6	24203	24208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018688	ACT	2	6	24214	24219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018688	TAG	2	6	24407	24412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018688	GGC	2	6	24419	24424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018688	AGG	2	6	24527	24532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018688	TCC	2	6	25786	25791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018688	T	6	6	25845	25850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018688	CAC	2	6	25905	25910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018688	TCC	2	6	26383	26388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018688	TGA	2	6	26422	26427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018688	TTTAT	2	10	26454	26463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018688	CTT	2	6	26643	26648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018688	AT	4	8	26806	26813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018688	CAT	2	6	26833	26838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018688	AT	4	8	26861	26868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018688	AAC	2	6	26883	26888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018688	CCT	2	6	27188	27193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018688	AAG	2	6	27204	27209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018688	AGT	2	6	27896	27901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018688	TTG	2	6	28104	28109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018688	CCTC	2	8	28374	28381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_018688	AT	3	6	28879	28884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018688	A	6	6	28888	28893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018688	ATT	2	6	28947	28952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018688	TA	3	6	29191	29196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018688	TTA	2	6	29201	29206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018688	TTA	3	9	29239	29247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018688	T	6	6	29841	29846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018688	ATA	2	6	29865	29870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018688	AT	4	8	29960	29967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018688	TAAA	2	8	29970	29977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018688	A	6	6	29983	29988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018688	T	6	6	31346	31351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018688	TAAG	2	8	31376	31383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018688	AAAT	2	8	31455	31462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018688	TTC	2	6	31490	31495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018688	TACA	2	8	31525	31532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018688	AAAT	2	8	31545	31552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018688	T	6	6	31569	31574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018688	A	9	9	31582	31590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018688	AT	3	6	31684	31689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018688	TTC	2	6	31765	31770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018688	TTTA	2	8	31774	31781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018688	A	6	6	31788	31793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018688	AGG	2	6	31795	31800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018688	T	6	6	31801	31806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018688	GTT	2	6	31811	31816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018688	A	7	7	32781	32787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018688	A	7	7	32811	32817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018688	AATAA	2	10	32879	32888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018688	AATTAT	2	12	32916	32927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018688	A	7	7	32946	32952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018688	AATT	2	8	33061	33068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018688	TATT	2	8	33079	33086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018688	TTA	2	6	33106	33111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018688	TCT	2	6	33161	33166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018688	T	7	7	33181	33187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018688	TCA	2	6	33272	33277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018688	AATT	2	8	33278	33285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018688	TAAT	2	8	33296	33303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018688	AAC	2	6	33369	33374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018688	AAC	2	6	33394	33399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018688	TC	3	6	33492	33497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018688	ATT	2	6	33507	33512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018688	GTAAA	2	10	33515	33524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018688	TAA	2	6	33548	33553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018688	T	7	7	33569	33575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018688	ATTT	2	8	33584	33591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018688	CAA	2	6	33603	33608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018688	AAT	2	6	33609	33614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018688	AT	3	6	33645	33650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018688	TAA	2	6	33677	33682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018688	TA	3	6	33716	33721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018688	TTA	2	6	33742	33747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018688	TAT	2	6	33753	33758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018688	ATACTA	2	12	33774	33785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_018688	T	7	7	33804	33810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018688	AAT	2	6	33853	33858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018688	ATA	2	6	33914	33919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018688	ATAC	2	8	33944	33951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018688	ACA	2	6	33967	33972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018688	ATAA	2	8	34006	34013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018688	T	6	6	34016	34021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018688	A	6	6	34047	34052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018688	CAA	2	6	34127	34132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018688	TAGT	2	8	34147	34154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018688	AATT	2	8	34159	34166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018688	TGT	2	6	34182	34187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018688	GTAT	2	8	34290	34297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018688	TACG	2	8	35234	35241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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